- Nhận biết các tế bào đã nhận được ADN tái tổ hợp.
- Giúp enzim cắt giới hạn (restrictaza) nhận biết vị trí cần cắt trên thể truyền.
- Dễ dàng chuyển ADN tái tổ hợp vào tế bào nhận
- Tạo điều kiện cho enzim nối (ligaza) hoạt động tốt hơn.